Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SERPINB3P29508 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINB3P29508 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms