Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD27P26842 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD27P26842 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD27P26842 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD27P26842 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD27P26842 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD27P26842 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD27P26842 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD27P26842 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD27P26842 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD27P26842 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD27P26842 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD27P26842 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD27P26842 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD27P26842 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD27P26842 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD27P26842 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD27P26842 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD27P26842 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms