Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms