Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GAP43P17677 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GAP43P17677 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GAP43P17677 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GAP43P17677 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GAP43P17677 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GAP43P17677 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAP43P17677 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAP43P17677 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAP43P17677 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GAP43P17677 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAP43P17677 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAP43P17677 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAP43P17677 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAP43P17677 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAP43P17677 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GAP43P17677 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAP43P17677 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms