Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGB4P16144 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB4P16144 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB4P16144 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms