Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV1P15498 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV1P15498 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV1P15498 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAV1P15498 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV1P15498 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV1P15498 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV1P15498 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAV1P15498 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV1P15498 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV1P15498 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV1P15498 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV1P15498 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAV1P15498 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAV1P15498 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAV1P15498 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAV1P15498 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms