Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPBP14678 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPBP14678 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms