Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I1P13073 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms