Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC192P0DO97 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms