Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB1P05556 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms