Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1RP00736 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1RP00736 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1RP00736 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1RP00736 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1RP00736 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1RP00736 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1RP00736 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C1RP00736 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1RP00736 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1RP00736 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1RP00736 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1RP00736 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms