Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms