Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF6BO95407 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms