Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LETM1O95202 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM1O95202 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM1O95202 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM1O95202 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM1O95202 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM1O95202 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM1O95202 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM1O95202 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM1O95202 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM1O95202 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM1O95202 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LETM1O95202 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM1O95202 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM1O95202 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM1O95202 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM1O95202 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM1O95202 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM1O95202 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM1O95202 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM1O95202 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM1O95202 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM1O95202 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM1O95202 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM1O95202 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM1O95202 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LETM1O95202 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms