Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4BO95155 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4BO95155 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4BO95155 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE4BO95155 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE4BO95155 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE4BO95155 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms