Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLIT2O94813 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLIT2O94813 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLIT2O94813 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms