Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms