Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX15O60248 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOX15O60248 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOX15O60248 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX15O60248 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX15O60248 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX15O60248 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX15O60248 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX15O60248 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX15O60248 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX15O60248 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX15O60248 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms