Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms