Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT21O43809 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT21O43809 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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