Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR2O43760 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms