Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3O43617 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms