Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCXO43602 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCXO43602 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCXO43602 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCXO43602 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCXO43602 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCXO43602 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCXO43602 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCXO43602 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCXO43602 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCXO43602 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCXO43602 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCXO43602 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCXO43602 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCXO43602 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCXO43602 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DCXO43602 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms