Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERI3O43414 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERI3O43414 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERI3O43414 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERI3O43414 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERI3O43414 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERI3O43414 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERI3O43414 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERI3O43414 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERI3O43414 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERI3O43414 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERI3O43414 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERI3O43414 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERI3O43414 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERI3O43414 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERI3O43414 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERI3O43414 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERI3O43414 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms