Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA3O43365 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms