Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 DOCK1-204ENST00000484400 779 ntTSL 36.58□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 29.7
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RBFOX2O43251 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 516.2■□□□□ 0.186e-13■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 214.82□□□□□ -0.043e-10■■■■■ 29.7
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RBFOX2O43251 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 217.49■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 29.7
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RBFOX2O43251 SLC39A4-204ENST00000527148 684 ntTSL 216.32■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 SLC39A4-207ENST00000531013 795 ntTSL 214.85□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 SLC39A4-206ENST00000530807 498 ntTSL 212.56□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 SLC39A4-205ENST00000529462 2778 ntTSL 212.45□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 SLC39A4-209ENST00000532718 668 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 29.7
RBFOX2O43251 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 214.88□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 311.95□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 SLC2A1-209ENST00000630821 591 ntTSL 210.47□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 38.74□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 SLC2A1-207ENST00000629908 401 nt6.71□□□□□ -1.348e-7■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.875e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.965e-8■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 CYTH3-207ENST00000481329 534 ntTSL 412.19□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.394e-10■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 DAP-206ENST00000514882 562 ntTSL 47.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 MAN2C1-212ENST00000563441 2664 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 THOC6-210ENST00000576143 960 ntTSL 317.25■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 411.47□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 CAP2-204ENST00000476263 891 ntTSL 59.6□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 NDE1-206ENST00000572967 484 ntTSL 39.5□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 CAP2-201ENST00000229922 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 NAB1-209ENST00000448811 590 ntTSL 48.87□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 NAB1-204ENST00000416973 568 ntTSL 48.06□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 CAP2-205ENST00000479291 1378 ntTSL 1 (best)7.97□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 NDE1-208ENST00000573694 411 ntTSL 37.75□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 AC004678.1-201ENST00000615016 929 ntBASIC7□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.382e-8■■■■■ 29.6
RBFOX2O43251 ACSF3-209ENST00000537895 550 ntTSL 45.92□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 29.6
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RBFOX2O43251 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)7.92□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 SURF4-204ENST00000465565 400 ntTSL 315.61■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 VOPP1-214ENST00000462326 536 ntTSL 413.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 29.5
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