Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPL2O15504 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPL2O15504 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUPL2O15504 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUPL2O15504 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUPL2O15504 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms