Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBDO15205 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBDO15205 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBDO15205 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBDO15205 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBDO15205 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBDO15205 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBDO15205 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBDO15205 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms