Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF5O14894 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF5O14894 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF5O14894 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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