Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE40O14503 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE40O14503 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms