Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HHLA1C9JL84 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHLA1C9JL84 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms