Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT4C9JH25 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRT4C9JH25 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms