Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-1B6SEH8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-1B6SEH8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-1B6SEH8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms