Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOBPA7XYQ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOBPA7XYQ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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