Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L1PA6NM43 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms