Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GOLGA6L3A6NEY3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6L3A6NEY3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L3A6NEY3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms