Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GMNCA6NCL1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms