Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD3A2A2Y4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms