Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0J9YY99 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YY99 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms