Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXY3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXY3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXY3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms