Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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