Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms