Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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