Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FAAH2-201ENST00000374900 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ANKUB1-202ENST00000462519 2222 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms