Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3GL2Q99962 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms