Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms