Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms