Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms