Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2D1P51668 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms