Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MIR4761-201ENST00000585066 82 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC006547.1-207ENST00000601746 930 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC006547.1-210ENST00000609644 589 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 HTATSF1P1-201ENST00000432008 984 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SLC16A14P1-201ENST00000506846 1117 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MIR4689-201ENST00000582517 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MIR4294-201ENST00000584548 76 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PSORS1C2-201ENST00000259845 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZNF343-202ENST00000358413 771 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RN7SL614P-201ENST00000461850 280 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC091544.2-201ENST00000555864 414 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC084064.1-201ENST00000569938 419 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC006111.1-201ENST00000573982 329 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC127526.5-201ENST00000637148 1110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 E2F6P4-201ENST00000468625 514 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 PHBP8-201ENST00000493810 725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC034229.1-201ENST00000506299 943 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC084033.3-203ENST00000546580 571 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 IGHV1OR16-2-201ENST00000564937 349 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZNF548-207ENST00000597400 589 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC091167.7-201ENST00000622269 518 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRMP28827 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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